Nel bel mezzo dell’epoca Edo, quella dei grandi samurai, piombano dal cielo degli alieni che si fanno chiamare Amanto, i quali, forti della loro superiorità tecnologica, conquistano la Terra. La casta dei samurai viene abolita e i nobili guerrieri privati della spada, che considerano la loro stessa anima. Tuttavia, qualcuno non è disposto ad accettare questa imposizione: si tratta di Gintoki Sakata, ragazzaccio ribelle e impulsivo, che con un gruppo di amici cerca di tirare avanti senza tradire i principi del vero samurai...

Torna in scena Tosshi, la personalità otaku di Hijikata manifestatasi per la prima volta a causa della maledizione della spada demoniaca! Il vice capo della Shinsengumi sfida il corpo ammiratori dell’idol Tsu Terakado per il riconoscimento dell’ufficialità del suo fan club, mentre intanto a Edo crescono le lamentele intorno a una bancarella e si va diffondendo un terribile virus...